|
Title
|
شناسايي ژن هاي مرتبط با فروپتوزيس در سرطان هاي گوارشي با تحليل داده هاي NGS
|
|
Type
|
Presentation
|
|
Keywords
|
فروپتوزيس، سرطان دستگاه گوارش، ژن هاي تغيير بيان يافته، ميكروآران اي، فاكتورهاي رونويسي
|
|
Abstract
|
فروپتوزيس، مرگ سلولي وابسته به آهن، در پاتوژنز سرطان هاي گوارشي نقش كليدي دارد. بررسي ژن هاي مرتبط با فروپتوزيس مي تواند اهداف درماني جديدي شناسايي كند. به اين منظور داده هاي بيان ژني NGS از پايگاه Xenobrowser براي تومور و حاشيه تومور استخراج شد. ژن هاي مرتبط با فروپتوزيس از GeneCards جمع آوري و مشتركات آن ها با ژن هاي تغيير بيان يافته در سه سرطان مري، معده و كولون با Venn diagram شناسايي شدند. تحليل غني سازي ژن هاي به دست آمده با Enrichr، بررسي miRNA هاي هدف قرار دهنده اين ژن ها با miRTarBase و فاكتورهاي رونويسي موثر بر بيان ژن هاي به دست امده با Transcription Factor PPIs انجام شد. 63 ژن مشترك فروپتوزيس كه در هر سه سرطان تغيير بيان داشتند شناسايي شد. مسير HIF-1 signaling در KEGG با كمترين p-value برجسته بود. hsa-miR-124-3p، 15 ژن فروپتوزيس را هدف گيري مي كند. كم ترين p-value در آنتولوژي عملكرد مولكولي مربوط به Aldose Reductase (NADPH) Activity، در اجزاي سلولي مربوط به Intracellular Organelle Lumen و در فرايندهاي زيستي مربوط به Aminoglycoside Antibiotic Metabolic Process بود. دو فاكتور رونويسي PML و BRCA1، 14 ژن از اين مجموعه ژني را تنظيم مي كنند. اين مطالعه نقش فروپتوزيس را در سرطان هاي گوارشي تأييد كرد و ژن ها/مسيرهاي مرتبط را به عنوان اهداف تشخيصي/درماني پيشنهاد مي دهد.
|
|
Researchers
|
Zeinab Esmaleili nia (First researcher) , Amirhossein Ahmadi (Second researcher)
|