31 فروردین 1403

غلامرضا عبدی

مرتبه علمی: استادیار
نشانی: پژوهشکده خلیج فارس - گروه زیست فناوری
تحصیلات: دکترای تخصصی / بیوتکنولوژی گیاهان دارویی
تلفن: -
دانشکده: پژوهشکده خلیج فارس

مشخصات پژوهش

عنوان
تمایز جغرافیایی و طبقه بندی نمونه های جلبک خلیج فارس بر اساس ترکیب شیمیایی با استفاده از طیف جذبیUV-Vis - FTIR و کمومتریکس
نوع پژوهش پارسا
کلیدواژه‌ها
تمایز جغرافیایی، طبقه بندی ، جلبک
پژوهشگران فاطمه طوسی (دانشجو) ، مریم عباسی طریقت (استاد راهنما) ، غلامرضا عبدی (استاد مشاور)

چکیده

زمینه: محدودیت هایی در تعیین محتوا و ترکیبات عملکردی جلبک ها در گونه های مختلف، فصلها و محیط های ساحلی وجود دارد. بنابراین، تقاضا برای غربالگری ترکیبات گونه ها برای دسترسی آسان، یافتن خواص و اطلاعات در جلبک ها بسیار مهم است. FTIR می تواند علائم و ویژگی های طیفی خاص گونه را نشان دهد و UV-Vis می تواند اطلاعاتی در مورد رنگدانه ها و متابولیت های آن ها ارائه دهد. با ترکیب داده های طیف سنجی با تکنیک های کمومتریکس می توان تخمین دقیقی درباره گروه های عاملی مختلف و ترکیب جلبک ها بدون تعیین کمی محتویات سلولی انجام داد. بر اساس یافته ها، تنوع گونه های جلبک بدون زمان بر بودن آماده سازی نمونه، اندازه گیری محتوای سلولی و مصرف زیاد مواد برای آنالیز انجام شد. هدف: هدف اصلی مطالعه حاضر نشان دادن مزیت ترکیب داده های طیف سنجی با رویکردهای کمومتریکس برای تمایز و شناسایی گونه های جلبک دریایی است که از محیط های مختلف ساحلی برداشت شده اند. همچنین کاهش ابعاد با خوشه بندی متغیرهای به دست آمده توسط نقشه خودسازمانده کوهنن (SOM) مورد توجه ما است. ترکیب داده های طیف سنجی مختلف، اطلاعات هم افزایی در مورد گروه های عملکردی مختلف و رنگدانه های فیتوشیمیایی های فعال زیستی ایجاد می کند و از این رو، نتایج طبقه بندی را افزایش می دهد. روش‏شناسی: مجموعه داده ها برای حذف نویز و تداخل های زمینه و بهبود صحت طبقه بندی، با مقیاس خودکار و صاف سازی ساوگل پیش پردازش شدند. همچنین نقشه خودسازمانده کوهونن (SOMs) برای کاهش ابعاد داده ها در نظر گرفته شد. تجزیه و تحلیل مؤلفه اصلی (PCA)، آنالیز متمایزPCA ((PCA-DA، و آنالیز حداقل مربعات جزئی ((PLS-DA برای تمایز استفاده شد. مزایای هم افزایی با استراتژی تلفیق داده ها در نظر گرفته شد. ماتریس فیوژن توسط ترکیبی از بهترین خوشه های SOM از طیف های FTIR و UV-Vis ایجاد شد. صحت، حساسیت و ویژگی واری برای تشخیص گونه ها از یک دیگر نزدیک به 100٪ بود. بر اساس دانش ما، کار فعلی اولین مطالعه ای است که به بررسی همجوشی خوشه-های SOMs از تکنیک های پیشنهادی برای شناسایی جلبک ها می پردازد. نتیجه‏گیری:شناسایی و تشخیص بسیار سریع و دقیق گونه ها برای یافتن آسان اطلاعات در جلبک ها انجام شد. مقایسه نتایج نشان داد که پارامترهای طبقه بندی به دست آمده با روش همجوشی SOMs نسبت به مدل های دیگر بهتر بوده و