|
Title
|
مقايسه مولكولي ميگوي Penaeus semisulcatus و زيرگونه آن P. semisulcatus persicus با استفاده از بخشي از ژنوم ميتوكندريايي
|
|
Type
|
Thesis
|
|
Keywords
|
Penaeus semisulcatus، mitochondrial genome, geneyic distance، Penaeus semisulcatus persicus
|
|
Abstract
|
ميگوي ببري سبز خليج فارس،P. semisulcatus يكي از مهم ترين اعضاي خانواده پنائيده در خليج فارس است. براساس خصوصيات مورفولوژيك و الگوي رنگ بندي بدن ، زيرگونه جديدي از آن، با نام p.(penaeus) semisulcatus persicus شناسايي شده است. در اين مطالـعه قطعه اي از ژنوم ميتوكندري به طول تقريبي حدود 3900bp( ناحيه 1تا 3900) براي مقايسه مولكولي ميان گونه و زير گونه مورد استفاده قرار گرفت. براي اين منظور يك نمونه از گونه ويك نمونه از زير گونه جمع آوري و DNA ماهيچه اي استخراج شده از بافت ماهيچه اي آن به عنوان الگو مورد استفاده قرار گرفت. زوج آغازگرهاي mt F1/mtR1،mtF2/mtR2 و mtF3/mtR3 براي تكثير و تعيين قطعات ميتوكندري استفاده شدند. بنابراين 3 محصول PCR به دست آمد.سپس براساس نقاط همپوشاني محصولات PCR فوق ترادف ميتوكندري در گونه و زير گونه حاصل شد.آناليز توالي ها نشان داد كه اين نواحي در گونه و زير گونه داراي 8 مولكول tRNA براي اسيدهاي آمينه Ileu،Gln،Met،Trp،Cys،Tyr،Leu، Lys و سه ژن كدكننده براي ND2،COI و COII است. آناليز همرديفي و فاصله ژنتيكي توالي ها با استفاده از نرم افزارهاي ClustalW2 و MEGA 6 حاصل شد. نتايج حاصل از آناليز توالي ها، نشان دادكه هر سه ژن مذكور غني از AT هستند. و گونه و زيرگونه تشكيل دو شاخه جداگانه مي دهند. فاصله ژنتيكي بر اساس ژن هايND2،COI وCOII به ترتيب017/0±234/0 ،011/0±148/0 و 014/0±126/0 محاسبه شد. آناليز فيلوژنتيك نشان داد كه گونه و زيرگونه مذكور در مقايسه با ساير گونه هاي جنس Penaeus رابطه ژنتيكي نزديك-تري به هم دارند. داده هاي فوق وقوع دو گونه پنهان در ميگوي ببري سبز را مورد توجه قرار مي دهد.
|
|
Researchers
|
Seyed Javad Hosseini (Primary advisor) , Sedigheh Hashemnia (Advisor)
|