مشخصات پژوهش

عنوان	مقایسه مولکولی میگوی Penaeus semisulcatus و زیرگونه آن P. semisulcatus persicus با استفاده از بخشی از ژنوم میتوکندریایی
نوع پژوهش	پایان‌نامه
کلیدواژه‌ها	Penaeus semisulcatus، mitochondrial genome, geneyic distance، Penaeus semisulcatus persicus
چکیده	میگوی ببری سبز خلیج فارس،P. semisulcatus یکی از مهم ترین اعضای خانواده پنائیده در خلیج فارس است. براساس خصوصیات مورفولوژیک و الگوی رنگ بندی بدن ، زیرگونه جدیدی از آن، با نام p.(penaeus) semisulcatus persicus شناسایی شده است. در این مطالـعه قطعه ای از ژنوم میتوکندری به طول تقریبی حدود 3900bp( ناحیه 1تا 3900) برای مقایسه مولکولی میان گونه و زیر گونه مورد استفاده قرار گرفت. برای این منظور یک نمونه از گونه ویک نمونه از زیر گونه جمع آوری و DNA ماهیچه ای استخراج شده از بافت ماهیچه ای آن به عنوان الگو مورد استفاده قرار گرفت. زوج آغازگرهای mt F1/mtR1،mtF2/mtR2 و mtF3/mtR3 برای تکثیر و تعیین قطعات میتوکندری استفاده شدند. بنابراین 3 محصول PCR به دست آمد.سپس براساس نقاط همپوشانی محصولات PCR فوق ترادف میتوکندری در گونه و زیر گونه حاصل شد.آنالیز توالی ها نشان داد که این نواحی در گونه و زیر گونه دارای 8 مولکول tRNA برای اسیدهای آمینه Ileu،Gln،Met،Trp،Cys،Tyr،Leu، Lys و سه ژن کدکننده برای ND2،COI و COII است. آنالیز همردیفی و فاصله ژنتیکی توالی ها با استفاده از نرم افزارهای ClustalW2 و MEGA 6 حاصل شد. نتایج حاصل از آنالیز توالی ها، نشان دادکه هر سه ژن مذکور غنی از AT هستند. و گونه و زیرگونه تشکیل دو شاخه جداگانه می دهند. فاصله ژنتیکی بر اساس ژن هایND2،COI وCOII به ترتیب017/0±234/0 ،011/0±148/0 و 014/0±126/0 محاسبه شد. آنالیز فیلوژنتیک نشان داد که گونه و زیرگونه مذکور در مقایسه با سایر گونه های جنس Penaeus رابطه ژنتیکی نزدیک-تری به هم دارند. داده های فوق وقوع دو گونه پنهان در میگوی ببری سبز را مورد توجه قرار می دهد.
پژوهشگران	ضیا سیما (دانشجو)، سیدجواد حسینی (استاد راهنما)، صدیقه هاشم نیا (استاد مشاور)