مشخصات پژوهش

عنوان	شناسایی ژن های مرتبط با فروپتوزیس در سرطان های گوارشی با تحلیل داده های NGS
نوع پژوهش	مقالات در همایش ها
کلیدواژه‌ها	فروپتوزیس، سرطان دستگاه گوارش، ژن های تغییر بیان یافته، میکروآران ای، فاکتورهای رونویسی
چکیده	فروپتوزیس، مرگ سلولی وابسته به آهن، در پاتوژنز سرطان های گوارشی نقش کلیدی دارد. بررسی ژن های مرتبط با فروپتوزیس می تواند اهداف درمانی جدیدی شناسایی کند. به این منظور داده های بیان ژنی NGS از پایگاه Xenobrowser برای تومور و حاشیه تومور استخراج شد. ژن های مرتبط با فروپتوزیس از GeneCards جمع آوری و مشترکات آن ها با ژن های تغییر بیان یافته در سه سرطان مری، معده و کولون با Venn diagram شناسایی شدند. تحلیل غنی سازی ژن های به دست آمده با Enrichr، بررسی miRNA های هدف قرار دهنده این ژن ها با miRTarBase و فاکتورهای رونویسی موثر بر بیان ژن های به دست امده با Transcription Factor PPIs انجام شد. 63 ژن مشترک فروپتوزیس که در هر سه سرطان تغییر بیان داشتند شناسایی شد. مسیر HIF-1 signaling در KEGG با کمترین p-value برجسته بود. hsa-miR-124-3p، 15 ژن فروپتوزیس را هدف گیری می کند. کم ترین p-value در آنتولوژی عملکرد مولکولی مربوط به Aldose Reductase (NADPH) Activity، در اجزای سلولی مربوط به Intracellular Organelle Lumen و در فرایندهای زیستی مربوط به Aminoglycoside Antibiotic Metabolic Process بود. دو فاکتور رونویسی PML و BRCA1، 14 ژن از این مجموعه ژنی را تنظیم می کنند. این مطالعه نقش فروپتوزیس را در سرطان های گوارشی تأیید کرد و ژن ها/مسیرهای مرتبط را به عنوان اهداف تشخیصی/درمانی پیشنهاد می دهد.
پژوهشگران	زینب اسماعیلی نیا (نفر اول)، امیرحسین احمدی (نفر دوم)
تاریخ انجام	1404-08-02