مشخصات پژوهش

عنوان	بررسی چندشکلی های تک نوکلئوتیدی در جایگاه g.657G/T در ژن PEN2-1 و ارتباط آن با مقاومت به بیماری نکروز حاد هپاتوپانکراس (AHPND) در میگوی سفید غربی (Litopenaeus vannamei)
نوع پژوهش	پایان‌نامه
کلیدواژه‌ها	میگوی سفید غربی، AHPND، ژن PEN2-1، چندشکلی تک نوکلئوتیدی (SNP)، ARMS-PCR
چکیده	زمینه: بیماری نکروز حاد هپاتوپانکراس (AHPND) یکی از مهم ترین چالش های صنعت پرورش میگوی سفید غربی (Litopenaeus vannamei) به شمار می رود که موجب تلفات گسترده و خسارات اقتصادی قابل توجه می شود. شناسایی نشانگرهای ژنتیکی مرتبط با مقاومت به این بیماری می تواند نقش مهمی در برنامه های اصلاح نژاد مبتنی بر انتخاب به کمک نشانگر (MAS) ایفا کند. هدف: این مطالعه با هدف بررسی ارتباط جایگاه SNP g.657G/T از ژن PEN2-1 با مقاومت به بیماری AHPND در میگوی سفید غربی انجام شد. نتایج این مطالعه به توسعه برنامه های اصلاح نژادی مقاومت به این بیماری کمک خواهد کرد. روش‏شناسی: در این مطالعه، تعداد 149 نمونه میگوی سفید غربی شامل 75 نمونه مقاوم و 74 نمونه حساس از مزارع پرورشی درگیر با بیماری AHPND در شهر بوشهر جمع آوری شد. تعیین ژنوتیپSNP مورد نظر با استفاده از تکنیک ARMS-PCR انجام و محصولات تکثیرشده به وسیله الکتروفورز روی ژل آگارز تفکیک شد. به منظور تأیید نتایج PCR، توالی یابی قطعه تکثیر شده با روش سانگر انجام و نتایج با استفاده از ابزار BLASTn در پایگاه داده NCBI مقایسه شد. فراوانی‏های آللی و ژنوتیپی محاسبه و تعادل هاردی–واینبرگ بررسی گردید. همچنین، ارتباط ژنوتیپ ها با مقاومت به بیماری با استفاده از رگرسیون لجستیک دوجمله ای در قالب مدل خطی تعمیم یافته (GLM) مورد ارزیابی قرار گرفت. تمام تجزیه و تحلیل‏های آماری با استفاده از نرم‏افزار SAS v. 9.4 انجام شد. یافته‏ها: نتایج این مطالعه نشان داد که فراوانی ژنوتیپ های GG، GT و TT به ترتیب 38/7 درصد، 62/92 درصد و صفر درصد بود. فروانی الل‏های G و T به ترتیب 5369/0 و 4631/0 محاسبه شد. توالی یابی قطعه ژنی تکثیرشده، 99 درصد همانندی با توالی مرجع ژن PEN2-1 میگوی سفید غربی (DQ206401.1) را تأیید کرد. آزمون تعادل هاردی–واینبرگ انحراف بسیار معنی داری از تعادل را نشان داد (P<0.05). نتایج آزمون کای دو نشان داد بین SNP مورد مطالعه (g.657G/T) و مقاومت به AHPND ارتباط معنی دار وجود داشت (P<0.05). نسبت شانس (OR) زنده مانی ژنوتیپ‏ GG به ژنوتیپ GT برابر با 23/11 شد؛ یعنی میگوهای دارای ژنوتیپ‏ GG، حدود 11 برابر شانس زنده مانی یا مقاومت بیشتری در مواجهه با بیماری AHPND نسبت به میگوهای با ژنوتیپ GT داشتند. نتیجه‏گیری: در مجموع، نتایج این پژوهش نشان داد که SNP g.657G/T از
پژوهشگران	مدینه رنجبر (دانشجو)، سیدجواد حسینی (استاد راهنما اول)، امیرحسین احمدی (استاد مشاور)، رضا پسندیده (استاد راهنما دوم)
تاریخ انجام	1405-04-31